Keragaman Gen Cytochrome B Pada Sidat (Anguila bicolor) Berdasarkan Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)
Downloads
ABSTRAK
Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakter genetik Anguilla bicolor berdasarkan gen cytochrome b sebagai informasi dasar dalam studi filogeni dan rekayasa genetika. Penelitian telah dilaksanakan pada bulan Mei sampai September 2013 di Laboratorium Bioteknologi Fakultas MIPA Universitas Brawijaya. Penelitian ini menggunakan metode survei dengan analisis deskriptif kualitatif di laboratorium. Sampel diperoleh dari penangkapan langsung di Pantai Popo Tulungagung, Manado, Medan dan Ciamis. .Penelitian ini dimulai dengan isolasi DNA menggunakan metode CTAB dan dilanjutkan dengan PCR. Primer yang digunakan yaitu cytb-1(5'-TGCTAACGATGCCCTAGTGG-3') dan cyt b-2 (5'-CTAGTCAACCTACT-AATGGG-3'). Hasil PCR dipotong dengan menggunakan enzyme retriksi Hha1 dan Msp1. Analisis data dilakukan dengan bantuan program Software NTSYS. Karakter genetik berupa urutan basa nukleotida penyusun DNA dari gen cytochrome b yang diperoleh pada masing-masing sampel memiliki tingkat kesamaan sekitar 32 – 100 %.
DAFTAR PUSTAKA
Aoyama, J., H. Sugeha, dan K. Tsukamoto. 2006. Downstream Migration of Tropical Anguillid Silver Eels. Prosiding Seminar Nasional Limnologi 2006
Avis, J.C. Lansman and R.O. Shade. 1979. The use Endonuclease to Mesure Mitochondria DNA Sequense Relatedness in Natural Populayions. I. Population Structure and Evolution in Genus Peromyscus. Genetic 92:279-295
Lutjanus malabaricus) Stock Descrimination Using Genetic Variation in Mitochondrial DNA. Molecular Fisheries Laboratory Southern Fisheries Centre. Produced for CSIRO Marine Laboratories as Part of The ACIAR Indonesia Snapper Project
Perez-Enriquez, R., Takagi, M. and Taniguchi, N. (2007). Genetic Variability And Pedigree Tracing Of A Hatchery-Reared Stock Of Redsea Bream (Pagrus Major) Used For Stock Enhancement, Based On Microsatellite DNA markers. Aquaculture 173, 413–423.
Primack, R. B. Supriatna, J. Indrawan, M. & Kramandibrata,P. 1998. Essentials of Conservation Biology. Sinauer Asssociate, Sunderland, Massachusetts.
Saputra, D. 2009. Gambaran (RFLP) Gen Sitokrom b DNA Mitokondria dari Sembilan Spesies Ikan Air Tawar. Skripsi Fakultas Kedokteran Hewan, Institut Pertanian Bogor.Setiawan I.E, Rovara, O dan M.H Amarullah. 2007. Mengenal Sumberdaya Ikan Sidat. BPPT-HSF, Jakarta. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor.
Sartika, Tike, 2000. Studi Keragaman Fenotip dan Genetik Ayam Kampung pada populasi dasar seleksi. Thesis. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor. Bogor
Setiawan I.E, Rovara, O dan M.H Amarullah. 2007. Mengenal Sumberdaya Ikan Sidat. BPPT-HSF, Jakarta. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor
Teng, H.Y, Y.S. Lin, dan T.S. Tzeng. 2009. A New Anguilla Species and a Reanalysis of the Phylogeny of Freshwater Eels. Department of Life Science, National Tsing Hua University, Hsinchu 300, Taiwan. J. 48(6): 808-822
Tesch, F.W. 1977. The eel biology and management of anguila eels. Chapman and Hall. London 434 p. genus anguila. University of Tokyo. J. coastal marine Sci. 32 (3)
Warwick, E.J., H.J.Astuti,M.J. and W. Hardjo Subroto, 1987. Pemuliaan. Ternak. Gajah Mada University Press. Jogjakarta
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- The copyright of this journal belongs to the Editorial Board and Journal Manager with the author's knowledge, while the moral right of the publication belong to the author.
- The formal legal aspect of journal publication accessibility refers to the Creative Commons Attribution-Share Alike (CC BY-SA).
- Every publication (print/electronic) is open access for educational, research, and library purposes. In addition to the objectives mentioned above, the editorial board is not responsible for copyright infringement
