Keragaman Gen Cytochrome B Pada Sidat (Anguila bicolor) Berdasarkan Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)

Lestari Wilujeng

= http://dx.doi.org/10.20473/jbp.v20i3.2018.194-201
Abstract views = 645 times | downloads = 1841 times

Abstract


ABSTRAK

Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis karakter genetik Anguilla bicolor berdasarkan gen cytochrome b sebagai informasi dasar dalam studi filogeni dan rekayasa genetika. Penelitian telah dilaksanakan pada bulan Mei sampai September 2013 di Laboratorium Bioteknologi Fakultas MIPA Universitas Brawijaya. Penelitian ini menggunakan metode survei dengan analisis deskriptif kualitatif di laboratorium. Sampel diperoleh dari penangkapan langsung di Pantai Popo Tulungagung, Manado, Medan dan Ciamis. .Penelitian ini dimulai dengan isolasi DNA menggunakan metode CTAB dan dilanjutkan dengan PCR. Primer yang digunakan yaitu cytb-1(5’-TGCTAACGATGCCCTAGTGG-3’) dan cyt b-2 (5’-CTAGTCAACCTACT-AATGGG-3’). Hasil PCR dipotong dengan menggunakan enzyme retriksi Hha1 dan Msp1. Analisis data dilakukan dengan bantuan program Software NTSYS. Karakter genetik berupa urutan basa nukleotida penyusun DNA dari gen cytochrome b yang diperoleh pada masing-masing sampel memiliki tingkat kesamaan sekitar 32 – 100 %.


Full Text:

PDF

References


DAFTAR PUSTAKA

Aoyama, J., H. Sugeha, dan K. Tsukamoto. 2006. Downstream Migration of Tropical Anguillid Silver Eels. Prosiding Seminar Nasional Limnologi 2006

Avis, J.C. Lansman and R.O. Shade. 1979. The use Endonuclease to Mesure Mitochondria DNA Sequense Relatedness in Natural Populayions. I. Population Structure and Evolution in Genus Peromyscus. Genetic 92:279-295

Lutjanus malabaricus) Stock Descrimination Using Genetic Variation in Mitochondrial DNA. Molecular Fisheries Laboratory Southern Fisheries Centre. Produced for CSIRO Marine Laboratories as Part of The ACIAR Indonesia Snapper Project

Perez-Enriquez, R., Takagi, M. and Taniguchi, N. (2007). Genetic Variability And Pedigree Tracing Of A Hatchery-Reared Stock Of Redsea Bream (Pagrus Major) Used For Stock Enhancement, Based On Microsatellite DNA markers. Aquaculture 173, 413–423.

Primack, R. B. Supriatna, J. Indrawan, M. & Kramandibrata,P. 1998. Essentials of Conservation Biology. Sinauer Asssociate, Sunderland, Massachusetts.

Saputra, D. 2009. Gambaran (RFLP) Gen Sitokrom b DNA Mitokondria dari Sembilan Spesies Ikan Air Tawar. Skripsi Fakultas Kedokteran Hewan, Institut Pertanian Bogor.Setiawan I.E, Rovara, O dan M.H Amarullah. 2007. Mengenal Sumberdaya Ikan Sidat. BPPT-HSF, Jakarta. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor.

Sartika, Tike, 2000. Studi Keragaman Fenotip dan Genetik Ayam Kampung pada populasi dasar seleksi. Thesis. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor. Bogor

Setiawan I.E, Rovara, O dan M.H Amarullah. 2007. Mengenal Sumberdaya Ikan Sidat. BPPT-HSF, Jakarta. Program Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor

Teng, H.Y, Y.S. Lin, dan T.S. Tzeng. 2009. A New Anguilla Species and a Reanalysis of the Phylogeny of Freshwater Eels. Department of Life Science, National Tsing Hua University, Hsinchu 300, Taiwan. J. 48(6): 808-822

Tesch, F.W. 1977. The eel biology and management of anguila eels. Chapman and Hall. London 434 p. genus anguila. University of Tokyo. J. coastal marine Sci. 32 (3)

Warwick, E.J., H.J.Astuti,M.J. and W. Hardjo Subroto, 1987. Pemuliaan. Ternak. Gajah Mada University Press. Jogjakarta


Refbacks

  • There are currently no refbacks.


View My Stats

             

 

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.