Tilapia Lake Virus (TiLV) Examination on Commodities of Tilapia (Oreochromis niloticus)
Downloads
The increasing utilization of the potential for fishery commodities and the traffic of fishery commodities between countries and between areas in the Indonesian territory is an opportunity for the risk of entry and spread of fish pests and diseases. One of the pathogens that are acute in nature that can cause great harm is a virus. The virus that often attacks freshwater fish is the Tilapia Lake Virus (TiLV). Virus examination using conventional PCR methods, starting with necropsy, fixation, extraction, amplification, electrophoresis, and reading the results. The aim of this study was to detect the presence of TiLV infection in freshwater fish commodities using the Polymerase Chain Reaction PCR method. This research was conducted on 23 December 2019-27 January 2020 at the Fish Quarantine Station for Quality Control and Safety of Fishery Products in Yogyakarta. The samples examined were 14 samples of tilapia. Based on the test results, it was found that 2 positive samples contained TiLV RNA which showed a band at 250 bp length (base pairs) in tilapia seeds.
Keywords: Tilapia Commodity, PCR method, TiLV.
Ariyanti, Y. dan S. Sianturi. 2019. Ekstraksi DNA Total dari Sumber jaringan Hewan (Ikan Kerapu) Menggunakan Metode Kit for Animal Tissue. Journal of Science and Applicative Technology, 3(1 : 40-45.
Bacharach, E., Mishra, N., Briese, T., Zody, M.C., Kembou Tsofack, J.E., Zamostiano, Lipkin, W. I., Kabuusu, R. M., Ferguson. 2016. Characterization of a Novel Orthomyxo-like Virus Causing Mass Die-Offs of Tilapia. mBIO, 7(2) : e00431-16.
Diansari, RR. V. R., E. Arini, T. Elfitasari. 2013. Pengaruh Kepadatan yang Berbeda terhadap Kelulushidupan dan Pertumbuhan Ikan Nila (Oreochromis niloticus) pada Sistem Resirkulasi dengan Filter Zeolit. Journal of Aquaculture Management and Technology, 2(3):37-45.
Handoyo, D., dan A. Rudiretna. Prinsip Umum dan Pelaksanaan Polymerase Chain Reaction (PCR). Unitas, 9 (1) : 17-29.
Iqbal, M., I. D., Buwono, dan N. Kurniawati. 2016. Analisis Perbandingan Metode Isolasi DNA untuk Deteksi White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada udang Vanname (Litopenaeus vannamei). Jurnla Perikanan Kelautan, 8 (1) : 54-65.
Kamaliah. 2017. Perbandingan Metode ekstrasksi DNA Phenol-Chloroform dan Kit Extraction pada Sapi Aceh dan Sapi Madura. Jurnal Biotik. 5 (1) : 60-65.
Keputusan Kepala Badan Karantina Ikan Pengendalian Mutu Ddan Keamanan
Hasil Perikanan Nomor 32/Kep-Bkipm/2015 Tentang Petunjuk Teknis Pemantauan Hama dan Penyakit Ikan Karantina.
Keputusan Kepala Badan Karantina Ikan, Pengendalian Mutu, dan Keamanan Hasil Perikanan Nomor 108/Kep-Bkipm/2017
tentang Analisis Risiko Penyakit Tilapia Lake Virus Pada Ikan Nila (Oreochromis Niloticus).
Keputusan Kepala Badan Karantina Ikan. Pengendalian Mutu, dan Keamanan Hasil Perikanan Nomor 73/Kep-Bkipm/2017 tentang Petunjuk Teknik Surveilan Penyakit Tilapia Lake Virus.
Keputusan Kepala Badan Karantina Ikan Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Nomor 99/Kep-Bkipm/2017 Tentang Kategorisasi Tingkat Risiko Media Pembawa Hama dan Penyakit Ikan Karantina Dan/Atau Hama Dan Penyakit Ikan Tertentu Serta Produk Lainnya.
Koesharyani, I., L. Gardenia, Z. Widowati, Khumaira, dan D. Rustianti. 2018. Studi Kasus Infeksi Tilapia Lake Virus (TiLV) pada Ikan Nila (Oreochromis niloticus) . Jurnal Riset Akuakultur, 13 (1) : 85-92.
Kurniawati, M. D., Sumaryam, dan N. Hayati. 2019. Aplikasi Polymerase Chain Reaction (PCR) Konvensional dan Real Time-PCR untuk Deteksi Virus VNN (Viral Nervous Necrosis) pada Ikan Kerapu Macan (Epinephelus fuscoguttatus). Jurnal Techno-Fish, 3 (1) : 19-30.
Langga, I. F., M. Restu, dan T. Kuswinanti. 2012. Optimalisasi Suhu dan Lama Inkubasi dalam Ekstraksi DNA Tanaman Bitti (Vitex Cofasus Reinw) serta Analisis Keragaman Genetik dengan Teknik RAPD-PCR. Jurnal
Sains dan Teknologi, 12 (3) : 265-267.
Marwayana, O. N. 2015. Ekstraksi Asam Deoksiribonukleat (DNA) dari Sampel Jaringan Otot. Oseana, 11 (2) : 1-9.
Muhsinin, S., M. M. Sulastri, dan D. Supriadi. 2018. Deteksi Cepat Gen InvA pada Salmonella spp. Dengan Medote PCRm. Jurnal Sains Farmasi dan Klinis, 5 (3) :191-200.
Mustahal, Manijo, dan C. Kirana. 2006. Pengujian Penyakit Koi Herpes Virus (KHV) pada Beberapa Ikan Budidaya. Jurnal Ilmu-ilmu Perairan dan perikanan Indonesia, 13(1) :21-26.
Nagasawa, K., Cruz-Lacierda, E.R (eds.). 2004. Diseases of cultured groupers. Southeast Asian Fisheries Development Center, Aquaculture Department, Iloilo, Philippines. 81 p.
Novita, H., T. Mufidah, dan I. Koesharyani. 2009. Perbandingan penggunaan Berbagai Preservasi RNA Jaringan dengan RNA Later, Alkohol, dan Alkohol Gliserol untuk Deteksi IMNV dengan PCR. Jurnal Ris. Akuakultur, 4 (3) : 377-383.
Ode, I. 2013. Kajian Sistem Imunitas untuk Pengendalian Penyakit pada Ikan dan Udang. Jurnal Ilmiah agribisnis dan perikanan, 6 (2) : 41-43.
Office International des Epizooties (OIE). 2009. Manual of Diagnostic Tests for
Aquatik Animal. 4th Edition. Office International Des Epizooties. France.
-167.
Pranawaty, R. N., Ibnu, D. B., dan Evi, L. 2012. Aplikasi Polymerase Chain Reaction (PCR) Konvensional dan Real Time PCR untuk Detekdi White
Spot Syndrome Virus pada Kepiting. Jurnal Perikanan dan Kelautan 3 (4).pp: 61-74.
Pratiwi, R. 2001. Mengenal Metode elektroforesis. Oseana, 26(1) : 25-31.
Ramlah, E. Soekendarsi, Z. Hasyim. 2016. Perbandingan Kandungan Gizi Ikan Nila Oreochromis niloticus Asal Danau Mawang Kabupaten Gowa dan danau Universitas Hasanuddin Kota Makassar.
Rau, C. H., A. Yudistira, dan H. E. I. Simbala. 2018. Isolasi, Identifikasi secara Molekuler Menggunakan Gen rRNA, dan Uji Aktivitas Antibakteri Bakteri Simbion Endofit yang Disolasi dari Alga Halimeda opuntia. Jurnal Ilmiah Farmasi-UNSRAT, 7 (2): 53-61.
Sirait, M. 2013. Kajian Pengembangan Perikanan Berbasis Komoditas Unggulan Di Kabupaten Muna. Jurnal Kelautan. 6(2) : 150-156.
Spetiawan, J. T., A. Nuryanto, H. Pramono, Kusbiyanto, dan P. H. T. Soedibja. 2016. Karakteristik Molekuler Ikan Gurami Soang (Osphronemus gouramy Lac.) yang Mati padaRentang Waktu Berbeda Menggunakan PCR-RFLP Gen Major Histocompatibility Complex Kelas II B. Biosfera, 33 (2) : 92- 101.
Staats, M., A. Cuenca, J. E. Richardo, R. Vrielink-Va Ginkel, G. Petersen, O. Sebeg, and F. T. Bakker. 2011. DNA Da,age in Plant Herbarium Tissue. PloS ONE, 6 (12) : e28448
Tsofack, J. E. k., Zamostiano, R. Watted, s., Berkowitz, E., Mishra, N., Briese, T., Lipkin, W. I., Kabuusu, R. M., Ferguson, H., Del Pozo, j., Eldar, A., and Bacharach, E. 2016. Detection of tilapia lave Virus (TiLV) in Clinical Sample by Culturing and Nested RT-PCR. Journal Clinical Microbial. JCM. 1 (8) :8-16.
Utami, S. T., D. F. Kusharyati, H. Pramono. 2013. Pemeriksaan Baktei Leptospira pada Sampel Darah Manusia Suspect Leptospirosis Mengguakan Metode PCR (Polymerase Chain Reaction). Balaba, 9 (2) :74-81.
Yusuf, Z. K. 2010. Polymerase Chain Reaction (PCR). Saintek, 5 (6) : 1-6.
