Variasi Presipitasi Pelarut pada Ekstraksi RNA dengan Metode Trizole dan Pengaruh terhadap Kemurnian RNA
Downloads
ABSTRAK
Virus dengue ditularkan oleh nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus. Nyamuk-nyamuk tersebut endemik di sebagian besar daerah vektor-vektor itu muncul memiliki empat serotipe yang berbeda secara antigenik. Empat serotipe virus dengue: DENV-1, DENV-2, DENV-3 dan DENV-4. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbandingan pelarut yang baik terhadap virus Dengue RNA Surabaya tipe-1 (DENV-1). Pelarut yang digunakan adalah Isopropanol, dimethyl sulfoxide, 96% ethanol, methanol, acetone-Methanol (1: 1), dimethyl formamide, dan akuades. RNA diisolasi dengan metode TRIzol. TRIzol (atau TRI Reagent) adalah larutan satu fasa dari fenol dan guanidinium isothiocyanate yang secara bersamaan melarutkan bahan biologis dan mendenaturasi protein. Hasil dari penilitian ini adalah didapatkan pelarut presipitasi RNA terbaik adalah aseton-metanol (1:1), karena campuran pelarut tersebut memiliki konstanta dielektrik terendah. Studi ini menunjukkan bahwa pelarut aseton-metanol (1:1) dapat digunakan sebagai pelarut presipitasi untuk mengisolasi RNA
Chomczynski, P. and N. Sacchi .1987. Single-step Method of RNA Isolation by Acid Guanidinium Thiocyanate-Phenol-Chloroform Extraction. Anal. Biochem; 162(1): 156–159.
Farrell, R.E. 2005. RNA methodologies: A Laboratory Guide for Isolation and Characterization. 3rd ed. Elsevier Academic Press, Burlington
Fatchiyah A, E.L. Arumingtyas., S.Widyarti., S.Rahayu .2011. Biologi Molekular Prinsip Dasar Analisis. Malang: Erlangga.
Gubler, D.J. 1988.Dengue, p. 223-260. In T. P. Monath (ed.), The arboviruses:epidemiology and ecology, vol. 2. CRC Press, Boca Raton, Fla
Halstead, S.B. 2008. Dengue Virus-Mosquito Interactions. Annu Rev Entomol; 5: 273-91.
Johnson, B.W., B.J. Russell., R.S. Lanciotti. 2005. Serotype-Specific Detection of Dengue Viruses in a Fourplex Real-Time Reverse Transcriptase PCR Assay, J. Clin Microbiol; 43(10): 4977-
Lanciotti, R.S., C.H. Calisher., D.J. Gubler.,G.J. Chang., and A.V. Vorndam .1992. Rapid detection and typing of
dengue viruses from clinical samples by using reverse transcriptase -polymerase chain reaction, J. Clin Microbiol; 30(3): 545-551
Maharani, A., T.H. Sucipto., H. Setyawati., S. Churrotin., I.H. Amarullah., P. Wardhani., A. Aryati., S. Ueda., and
S. Soegijanto .2018. RNA Isolation of Dengue Virus Type 1 with Different Precipitation Solvents: Dimethyl Sulfoxide, Acetone, and Ethanol 70%. Indo. J Trop Infect Dis; 7(3): 62-66
Mason, P.E., G.W. Neilson., C.E. Dempsey., A.C. Barnes., and J.M. Cruickshank.2003. The hydration structure of Guanidinium and Thiocyanate ions: Implications for protein stability in aqueous solution. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America; 100(8): 4557-4561
Rio, Rio, D.C., M. Ares Jr., G.J. Hannon., and T.W. Nilsen .2010. Purification of RNA using TRIzol (TRI Reagent). Cold Spring Harb Protoc; 5(6): 2010–2013
Untoro, Y.M., T.H. Sucipto., H.Setyawati.,S.Churrotin., I.H. Amarullah., P.Wardhani., A. Aryati., S. Ueda., and
S. Soegijanto .2018. RNA Isolation of Dengue Virus Type 2 with Different Precipitation Solvents : Methanol, Chloroform, and 2-Isopropanol. Jurnal Kimia Riset; 3(1): 52-57
WHO. 2017. Epidemiology Unit, Ministry of Health: Dengue update, 16 November 2017. https://reliefweb.int/report/srilanka/ epidemiology-unit-ministryhealth-dengue-update-16-november-2017
Veterinary Medicine Journal by Unair is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
1. The Journal allows the author to hold the copyright of the article without restrictions.
2. The Journal allows the author(s) to retain publishing rights without restrictions
3. The legal formal aspect of journal publication accessibility refers to Creative Commons Attribution Share-Alike (CC BY-SA).
11.jpg)
11.png)
